四隅にあるZ軸のネジを個別に回すことで修正することが可能です。
但し、この方法は機械を分解しないと個別に軸を回すことが出来ません。

プラスドライバーと一部機械ではトルクスドライバーでボディを外して、調整したいZ軸を引き抜いて調整後再度差し込むことで、XY平面とテーブルを平行にすることが出来ます。